이방원은 이성계에게 조선은 이씨의 나라가 아니라 정씨의 나라가 된 것 같다고 말하며 <조선경국전>을 폐기할 것을 요구한다. 정도전은 이방원을 점점 견제하고 이성계에게 자신 혹은 이방원 둘 중에 한 명을 선택할 것을 요구한다. 한편 주원장은 왕자 한명을 명으로 보내라고 하고 이에 정도전은 정안군, 이방원을 보낼 것을 주청하는데...
하륜은 이방원에게 자신이 이방원을 왕으로 만들어줄 것이라고 말하고 이방원은 반신반의하며 하륜을 곁에 둔다. 이성계는 도읍을 옮길 것을 천명하고 이에 윤소종과 남은, 조준은 거세게 반대를 한다. 한편 명에 갔던 정도전은 주원장에게 이성계의 책봉할 뜻이 없다는 대답을 듣고 마는데...
정도전은 간곡히 이성계에게 왕이 되어줄 것을 요구하고 이성계는 결국 받아들인다. 한편 왕씨를 중심으로 한 반혁명세력 척결을 앞두고 정도전 내 당여들 사이에 갈등을 빚고 이숭인은 결국 비참한 최후를 맞는다. 한편 세자 책봉을 앞두고 이방원은 긴장을 하며 사태 추이를 지켜보는데...
공양왕은 이성계가 다시 일어날 것을 두려워하고 이에 정몽주는 이성계를 ‘고려의 손’으로 처단해야 한다고 하면서 탄핵을 주청한다. 정도전은 처형장에 가기 직전 이성계를 향해, 대업을 이루지 못하고 먼저 죽는 본인의 불충을 용서해달라며 숙배를 올린다. 이성계의 마지막 답을 듣기 위해 이성계 집에 찾아온 정몽주, 이방원 칼을 옆에 차고 방문 앞에 서서 둘의 이야기를 듣는데...
정몽주는 정도전과 이성계를 역적이라고 비난하며, 같이 대업을 이끌어내자는 정도전의 청을 거절한다. 조준을 포함한 정도전의 당여들은 우왕과 창왕을 폐위시키고 이어서 이성계를 왕으로 선위시키려고 한다. 이 계획을 눈치챈 정몽주는 폐가 입진, ‘가짜 왕씨를 폐하고 진짜 왕씨를 세운다’는 명분을 내세워 정창군 왕요를 왕위에 올리고자 하는데...
김저와 정득후는 우왕의 명을 받아 이성계를 암살하기 위한 계략을 펼치고 이를 실행하기 위해 왕의 보검을 들고 곽충보를 찾아간다. 한편 정도전은 토지개혁에 대해 이견이 있는 이색의 제자들에게 각각 죄를 씌어 이색을 점점 사면초가에 빠지게 하는데.. 정몽주는 이런 정도전을 보면서 예전의 이인임과 다를 바가 없다며 화를 내는데...
이색과 그의 제자들, 그리고 변안열은 이성계에게 사신으로 명으로 갈 것을 주장하고 정도전과 그의 당여들은 위기에 빠지게 된다. 이때 정도전은 계략을 내어 이방원에게 아버지를 위해 희생할 수 있냐고 묻는다. 한편 최영의 처형 직전, 최영은 이성계를 불러서 최후의 유언을 남긴다. 이성계 눈시울이 붉어지는데...
조민수에 대한 국문이 시작되고 이성계와 정도전은 이인임을 찾아간다. 정도전의 멱살을 잡은 이인임... 정도전에게 자신의 예전 모습을 발견하고 소스라지게 놀란다. 한편 조준은 이성계에게 개혁의 일환으로 토지 개혁을 위해 계민수전을 역설한다. 정도전과 조준이 중심이 된 토지 개혁, 하지만 끝까지 반대를 하는 이색, 정도전에게 사제지간을 끊자고 말하고 돌아서는데...