유의태는 허준에게 사또의 치료를 맡기고 의원으로 돌아간다. 그리고 유의태는 허준을 다시 제자로 받아들이고 허준은 다시 의원에서 병자들을 치료한다. 한편, 오근은 약재창고에 있던 병부일지가 모두 사라진 것을 발견하는데...